VDAC2–某复合物 蛋白–蛋白分子对接与结合界面系统分析案例展示分析流程包括蛋白结构预处理、HDOCK 全局蛋白–蛋白对接、Top 100 候选构象提取并进一步结合原子碰撞、界面接触规模、膜环境空间合理性、界面残基预测置信度及结合位点聚类等多项指标对候选构象进行综合筛选。在最终候选复合物基础上进一步完成蛋白–蛋白界面残基识别、跨链接触统计、氢键与盐桥分析并对关键作用位点进行三维结构可视化。